El Consejo Interniversitario Nacional (CIN) fue creado por Decreto del Presidente de la República Argentina, Dr. Raúl Alfonsín, el 20 de diciembre de 1985. Durante los primeros meses de 1986, realizó varias reuniones para, finalmente, tener su primer Plenario entre el 2 y el 4 de octubre de ese año.

Se dictó su primer Estatuto el 19 de marzo de 1997 (Ac. Pl. Nº 225/97). Fue reformado en ocho oportunidades, en uno de esos casos para adecuarse a la Ley de Educación Superior (Ley Nº 24.521). El actualmente vigente puede ser consultado aquí.